学院坚持“立足水利、面向社会、打造品牌”的专业发展特色。学院在专业建设上正确把握“专业布局与市场需求、行业优势与特色发展、重点建设与全面发展”的关系，坚持走产教融合发展之路，逐步形成以水利施工、建筑施工、工程造价等专业为特色，以汽车维修、数控加工、机电一体化等专业为骨干，以计算机网络应用、多媒体制作等专业为补充的专业建设体系。山东水利技师学院开设技师、高级技工专业12个。山东省水利职工大学现开设成人大专专业10个。其中，全国水利高等职业教育示范专业2个；省级名牌、重点专业2个；全省“百强专业”1个；省级示范专业群 1个；省级一体化试点专业1个。具体如下： 

 水利水电工程施工    < 省级师范专业群核心专业、学生参加全国水利高职院校技能大赛获特等奖>

 建筑工程施工        < 省级示范专业群建设专业>

 工程造价            < 全国水利高等院校师范专业、省级重点专业>

 汽车维修            < 省级名牌专业、全省百强专业、省一体化教改试点专业>

 汽车技术服务与营销  < 学生参加全国技能大赛获一等奖>

 数控加工            < 学生参加全国技能大赛获一等奖>

 机电一体化技术      < 学生参加全国技能大赛一等奖>

 会计                < 学生参加全国技能大赛一等奖>

 计算机网络应用      < 学生参加全国技能大赛获二等奖>